Robomongo 0.8.x biedt geen ondersteuning voor de nieuwe SCRAM-SHA-1-authenticatie, de standaard authenticatiemethode die is toegevoegd in MongoDB 3.0.
Robomongo 0.9.0 RC4 (februari 2016) heeft ondersteuning toegevoegd voor SCRAM-SHA-1, maar als je een moderne versie van MongoDB-server gebruikt, moet je upgraden naar de nieuwste versie van Robomongo (nu Robo3T) die momenteel beschikbaar is.
Er is ook een officieel onderhouden gratis GUI, MongoDB Compass, die actiever wordt bijgewerkt dan Robo3T. MongoDB Compass 1.22+ (september 2020) bevat een ingebouwde MongoDB-shell.