Waarom deze update-query slechts één record één keer bijwerkt?

Dit is het standaardgedrag van MongoDB voor updates. Als u meerdere documenten tegelijk wilt bijwerken, moet u expliciet de multi . opgeven vlag:

db.collection.update( criteria, objNew, upsert, multi )

dus je zou moeten gebruiken

db.we.update({"uid":1, "status":1, "time" : {"$lte":1324403899}},
             {"$set":{status:0}}, 
             false, 
             true);

in plaats daarvan.

Uit de documentatie :