Een snelle grep van de bronstructuur lijkt erop te wijzen dat unieke indexen alleen worden gebruikt bij het invoegen, dus er mag geen prestatievoordeel of nadeel zijn tussen een zoekopdracht die één document retourneert, of de index nu uniek is of niet.
MongoDB-indexen zijn geïmplementeerd als btrees, dus het zou niet logisch zijn als ze anders zouden presteren, of de index nu uniek is of niet.