Mongoose probeert standaard een ObjectId in te stellen. U kunt dit onderdrukken met het volgende:
var categorySchema = mongoose.Schema({
_id: String,
ancestors: [{type: String }],
parent: {type: String}
},{ _id: false });
var Category = mongoose.model( "Category", categorySchema );
En merk op dat er maar één schema voor je lay-out is.