Oké, ik was slechts een update-operatie verwijderd. Ik heb het probleem opgelost met de volgende mongo-shell update commando om alle NaN . te vervangen s met null s:
De {multi: true} voor het vervangen van alle lucifers.
database_name.collection_name.update({"field_name_having_NaN": {$eq: NaN}}, {$set: {"field_name_having_NaN": null}}, {multi: true});
Referentie:MongoDB Field Update Operator - $set