Ik kom hetzelfde probleem tegen en na wat googlen en zoeken vond ik dit berichthttps://stackoverflow.com /a/43810346/3785901
Ik heb dit commando geprobeerd:
mongodump --host HOST:PORT --db SOURCE_DB --username USERNAME --password PASSWORD --archive | mongorestore --host HOST:PORT --nsFrom 'SOURCE_DB.*' --nsTo 'TARGET_DB.*' --username USERNAME --password PASSWORD --archive --drop
en het werkt als een tierelier. Het zou in jouw geval moeten werken, veel succes.