Nou, ik heb het eindelijk door - hoewel dit een beetje een brute force-methode is. Binnen de beheertools moest ik catalog.sql en catproc.sql uitvoeren - die de sys-objecten opnieuw creëerden.
Dit, gevolgd door utlrp.sql loste al mijn problemen op, en nu zijn alle objecten succesvol gecompileerd.