Ik had een probleem dat erg op het jouwe leek. Ik heb het kunnen oplossen door een andere verbindingsmethode te gebruiken:
my_dsn = cx_Oracle.makedsn("host",port,sid="sid")
connection = cx_Oracle.connect(user="user", password="password", dsn=my_dsn)
cursor = connection.cursor()
querystring = "SQL query"
cursor.execute(querystring)
Zie http://cx-oracle.readthedocs.io/en/latest/ module.html voor meer informatie