Het probleem is waarschijnlijk te wijten aan het feit dat socket-authenticatie standaard is ingeschakeld voor de root-gebruiker wanneer er geen wachtwoord is ingesteld, tijdens de upgrade naar ubuntu 16.04.
De oplossing is om terug te keren naar native wachtwoordverificatie. U kunt dit doen door u aan te melden bij MySQL met socket-authenticatie door het volgende te doen:
sudo mysql -u root
Eenmaal ingelogd:
ALTER USER 'root'@'localhost' IDENTIFIED WITH mysql_native_password BY 'password';
die teruggaat naar de oorspronkelijke (oude standaard) wachtwoordverificatie.
Gebruik nu wachtwoord als het wachtwoord wanneer vereist door MySQL.