Maak voor de zekerheid eerst een back-up van uw /var/lib/mysql/-map.
sudo mkdir /home/<your username>/mysql/
cd /var/lib/mysql/
sudo cp * /home/<your username>/mysql/ -R
Verwijder vervolgens MySQL (hiermee worden php5-mysql en phpmyadmin verwijderd, evenals een aantal andere bibliotheken, dus wees voorbereid om hierna enkele items opnieuw te installeren.
sudo apt-get purge mysql-server-5.1 mysql-common
Verwijder de map /etc/mysql/ en de inhoud ervan
sudo rm /etc/mysql/ -R
Controleer vervolgens of uw oude databasebestanden nog steeds in /var/lib/mysql/ staan, zo niet, kopieer ze dan terug naar de map en chown root:root
(voer deze alleen uit als de bestanden er niet meer zijn)
sudo mkdir /var/lib/mysql/
sudo chown root:root /var/lib/mysql/ -R
cd ~/mysql/
sudo cp * /var/lib/mysql/ -R
Installeer vervolgens mysql-server
sudo apt-get install mysql-server
Installeer ten slotte alle ontbrekende pakketten zoals phpmyadmin en php5-mysql opnieuw.