Je zult het met de hand moeten compileren, in plaats van via PECL. U moet weten waar uw MySQL-installatie is. Ik weet niets van de Entropy-pakketten, maar de builds van MySQL (die ik aanbeveel) worden geïnstalleerd in /usr/local/mysql .
$ pecl download pdo_mysql
$ tar xzf PDO_MYSQL-1.0.2.tgz
$ cd PDO_MYSQL-1.0.2
$ phpize
$ ./configure --with-pdo-mysql=/usr/local/mysql
$ make && sudo make install
En dat zou je op het punt moeten brengen waar je het kunt configureren.