Het lijkt erop dat je InnoDB gebruikt tabellen, dus u moet ook ib*-bestanden naar de gegevensmap kopiëren (maar dit overschrijft elke InnoDB-tabel die in een nieuwe installatie is gemaakt.)
Als alternatief (nog beter) kunt u de parameter 'datadir' in het configuratiebestand instellen en het pad naar de gegevensmap in de oude installatie specificeren.