Heb je erover nagedacht om de "IN"-clausule op MySQL te gebruiken?https://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/comparison-operators.html#function_in
Je zou waarschijnlijk zoiets hebben als:
$query = "SELECT * FROM ".$wpdb->usermeta." WHERE meta_key='company' AND meta_value IN ('".implode("', ', $brand)."')";
(bewerken: vergeten de haakjes rond de "in" inhoud toe te voegen)