Hoe kan ik twee tabellen op meerdere kolommen samenvoegen in CakePHP 3?

Ja, het is mogelijk. Gebruik gewoon arrays om de kolommen uit te drukken die moeten worden gekoppeld:

$this->belongsTo('Things', [
    'bindingKey' => ['key1', 'ke2'],
    'foreignKey' => ['fk1', 'fk2']
]);

Dat komt overeen met key1 = fk1 en key2 = fk2