Ik heb net een uur aan hetzelfde probleem besteed; Je hebt waarschijnlijk dezelfde typefout gemaakt als ik.
Het probleem voor mij zat in de .yml schemadefinitie. In de sectie waar ik de relaties tussen mijn tabellen definieerde, had ik deze doelentiteit:
targetEntity: mlEmailNotif
in plaats van
targetEntity: MlEmailNotif
Dus de kleine 'm' zorgt ervoor dat doctrine een nieuwe alias creëert voor een nieuwe tabel (de php-vergelijking is hoofdlettergevoelig).