Ik ontdekte dat dit gebeurde toen MySQL te veel RAM gebruikte. Deze vraag en dit bericht beide hielpen met een manier om te testen en een oplossing.
Voor mij, dit toe te voegen aan mijn /etc/mysql/my.cnf bestand heeft het probleem opgelost.
innodb_buffer_pool_size = 12M
Hier is hoe ik heb besloten hoeveel geheugen toe te wijzen. Start alles behalve MySQL en controleer hoeveel geheugen vrij is. Stel uw InnoDB-buffer in op 10% van dat bedrag. Voor mij was het 12M.