Alternatief voor databaseontwerp met opgesomde kolommen, wat leidt tot slechte prestaties

In plaats van

PRIMARY KEY (`expressionId`),
UNIQUE KEY `geneId` (`geneId`,`conditionId`),

gebruik

PRIMARY KEY(`geneId`,`conditionId`),
INDEX (`expressionId`),

Als er geen andere tabellen verwijzen naar expressionId , verwijder die kolom en de index erop.

Waarom helpt dit? De gegevens worden geclusterd met de primaire sleutel; u zoekt gegevens op met geneId , wat het begin is van de PK; vandaar dat de gegevens efficiënter kunnen worden opgehaald, vooral als de tabel veel groter is dan innodb_buffer_pool_size (wat ongeveer 70% van het RAM-geheugen zou moeten zijn).