select ref, count(distinct id) from table group by ref;
Dit geeft je een telling van verschillende ID's per ref.
select ref, count(*) from table group by ref;
Dit geeft u het aantal records per ref.
BEWERKEN:
Probeer dit om de gewenste output te krijgen.
select t.*, m.counter
from table t
join (
select ref, count(distinct id) as counter
from table group by ref
) m on t.ref = m.ref
Voorbeeld op SQLFiddle:http://sqlfiddle.com/#!9/2b93c/2