Je hebt gelijk, System.Data is er niet (ik zocht hetzelfde toen ik voor het eerst begon te rommelen met WinRT). U kunt er ook niet naar verwijzen. Als je met een SQL-database wilt praten, moet je een ander protocol gebruiken (WebService, SOAP, WCF, enz.).
Er zijn poorten voor SQLite beschikbaar die lijken te werken, waardoor je een lokale DB-optie krijgt, maar geen servergebaseerde zonder een soort tussenpersoon te gebruiken om bij de DB te komen.
Terzijde:ik had persoonlijk graag een desktop Metro-app gezien die verbinding zou kunnen maken met bijvoorbeeld een SQL Express-database, maar die is momenteel niet in de maak zonder door hoepels te springen.