Ik heb dit probleem opgelost door ODBC Driver 17 voor SQL Server vooraf te compileren op een machine waarop Ubuntu 18.04 draait en de libmsodbcsql-17.5.so.2.1 te kopiëren. en msodbcsqlr17.rll bestanden naar de juiste mappen via een Heroku-buildpack. Dit is ODBC-stuurprogramma 17.5 voor SQL Server en ik zal waarschijnlijk geen andere versies van dit stuurprogramma compileren, maar ik kan me voorstellen dat het concept hetzelfde blijft.
Het Heroku-buildpack en de bijbehorende vereisten zijn hier te vinden https://github.com/matt-bertoncello/python-pyodbc-buildpack.git