je zou hiervoor geen phpmyadmin moeten gebruiken, je zou mysqldump moeten gebruiken. vanaf de opdrachtregel is het
mysqldump -uMYSQL-USER -h server -pMYSQL-USER database_name > /path-to-export
van een php-script
$command = "mysqldump -uMYSQL-USER -h server -pMYSQL-USER database_name > /path-to-export/file.sql";
exec($command, $output, $return_var);
dit is eenvoudig te automatiseren met een cronjob