Als ik je vraag goed heb begrepen, wil je die documenten die dezelfde waarden hebben in veld1 en veld2.
Probeer hiervoor
db.coll.find({$where: function() { return this.field1 == this.field2 } } );
of compacter
db.coll.find({ $where : "this.field1 == this.field2" } );