Ik weet dat dit oud is, maar ik kwam het probleem tegen en kwam deze vraag tegen. Ik heb het kunnen oplossen.
Mijn probleem was op Ubuntu 18.04 en ik probeerde MongoDB 3.4/3.6 te installeren en uit te voeren.
Een probleem was een ontbrekende /var/run/mongodb-map met de juiste machtigingen, het andere was deze fout. Ik weet nog steeds niet 100% zeker of deze fout te maken had met de directory of niet, maar het had zeker iets te maken met de configuraties.
Mijn mongod.conf kreeg uiteindelijk processManagement - fork ingesteld op true. Door dat in false te veranderen, begon het te werken.