U moet een extra veld met geneste arraygrootte maken en $inc om dit veld bij te werken.
U kunt ook $ gebruiken waar , maar het is erg traag.
U zoekt als volgt op geneste arraylengte:
db.coll.find({ $where: "this.nestedArray.length > 3" });
Maar zoals ik al zei, het is beter om een extra veld aan te maken.