Dit gebeurt waarschijnlijk omdat u de Command Line Tools niet opnieuw hebt geïnstalleerd na het upgraden.
Gewoonlijk moet XCode worden geüpgraded naar de nieuwste versie (4.4) (ik geloof dat ik bij de update naar 10.8 ook een hele reeks andere applicaties heb bijgewerkt, waaronder XCode). Na de update moet u de Command Line Tools opnieuw installeren. Dit kan nu via een instelling in XCode:
Ga naar "Voorkeuren -> Downloads" en installeer "Command Line Tools".
Nu zou u geen problemen meer moeten hebben bij het installeren van pakketten die moeten worden gecompileerd.