MySQL is geen ingebedde database - de enige JAR die ermee verband houdt, is het JDBC-stuurprogramma. Het vereist een installatieproces, dat mogelijk via Java kan worden gescript, maar het proces zal zeker werken buiten de Java-toepassing die u wilt ondersteunen. Dit betekent dat u uw Java-toepassing kunt uitschakelen, maar dat de MySQL-service/daemon nog steeds actief is.
Alleen de libmysqld kan worden ingesloten.
Er zijn ingesloten databases - SQLite, Firebird - en ingesloten databases gemaakt in Java - HSQL, Derby/(kan me niet herinneren hoe het eerder heette). Ik geloof dat SQL Server Compact Edition kan worden ingesloten, terwijl SQL Server Express/MSDE dat niet is. Ik weet niet of Oracle een insluitbare versie heeft....