Hoe kan ik een MySQL-query versnellen met WHERE-clausules op twee kolommen?

U moet op beide velden één index hebben

ALTER TABLE alert_hit ADD INDEX `IDX-alert_id-timestamp` (`alert_id`, `timestamp`);

Ook zal MySQL de index met meerdere kolommen gebruiken tot aan het eerste veld waarvoor er een bereikvoorwaarde is in de WHERE-component, dus in dit geval is de volgorde van belang en timestamp zou als laatste in de index moeten staan.

Zoals voorgesteld door @spencer7593 door COUNT(1) te selecteren in plaats van count(id) misschien ook beter.