Als de tabel email_data_test MyISAM is en vergrendeld was, zou dat de INSERT hebben opgehouden.
Als de tabel email_data_test InnoDB is, werden er veel MVCC-gegevens geschreven in ib_logfiles, wat mogelijk nog niet is gebeurd.
In beide gevallen had u de LIMIT-clausule door 4.480.000 rijen laten scrollen om bij 10.000 rijen te komen die u eigenlijk nodig had om te INSERT.
Het doden van de query zorgt er alleen voor dat de InnoDB-tabel email_data_inno_stage een rollback uitvoert.