Stel meerdere 'verbindingsgroepen' in voor elke server in uw database.php-configuratiebestand en vervolgens in het Model:
$DB1 = $this->load->database('group_one', TRUE);
$DB2 = $this->load->database('group_two', TRUE);
//read from DB1
$DB1->query();
//write to DB2
$DB2->insert();
Zie voorbeelden in:Verbinding maken met meerdere databases