Als je het artikel hier leest:https://dba.stackexchange.com/questions/692/sql-server-2008-cross-database-performance-on-same-physical-machine-and-server u zult zich realiseren dat u geen prestatieverlies zult hebben, omdat query-optimizer er slechts één is. Het verschil is alleen als u zoekopdrachten tussen meerdere instanties gebruikt. In dit geval wordt de zoekopdracht op beide instanties geanalyseerd door afzonderlijke queryanalysatoren.
Mogelijke problemen die zich in uw geval kunnen voordoen, hebben te maken met beheer. Lees hier hoe u het eigendom van meerdere databases kunt beheren:http://msdn.microsoft.com/en-us/library/ms188676.aspx