Ik weet niet hoe je dit probleem zou kunnen oplossen met phpMyAdmin, maar er zijn andere tools die je kunnen helpen het gewenste effect te bereiken. Liquibase is een van hen. Ik heb het in het verleden een paar keer gebruikt en het was best goed. Het duurt even voordat je het onder de knie hebt, maar ik denk dat het je kan helpen.
