Elke extra software die u aan een systeem toevoegt, voegt complexiteit toe. Complexiteit is de vijand van veiligheid.
PHP-webapps zijn berucht om hun slordige codering en phpMyAdmin heeft zeker meer dan zijn aandeel aan beveiligingslekken in het verleden. U kunt de schade zeker beperken door bv. HTTPS achter zich laten met een clientcertificaat, maar dat zal niet voorkomen dat cross-site-request-forgery-aanvallen worden uitgevoerd.
Voor een productiemachine zou ik het liever bij de console houden.