Ik heb de oplossing.
Ik was aan het importeren/exporteren met phpmyadmin. Dus we hadden met deze problemen te maken.
Nu hebben we het geprobeerd met de opdrachtregel en alles werkt prima zonder problemen.
Gebruik dit voor export:
mysqldump -u username -p databasename > filename.sql
Gebruik dit om te importeren:
mysql -u username -p databasename < filename.sql