De uitvoering van de query is mislukt bij het uitvoeren van de Mongo-opdracht via het bash-script

Dat is geen javascript. U kunt geen extern uitvoerbaar bestand vanuit javascript aanroepen.

Voer gewoon de mongorestore . uit direct:

mongorestore --host=localhost --port=27017 --gzip --archive=C:\backup --nsInclude 'n2aenv.*' --nsFrom 'n2aenv.*' --nsTo 'newDB.*'