Wat de console.log uitgevoerd is de query en niet de resultaten. Ook hoeft de callback-indeling om de query op MongoDB vanuit Node.js af te vuren niet te wachten/async.
Het volgende zou moeten werken, ervan uitgaande dat Employee is een verzamelobject. Vermijd gewoon asynchrone/wachten in dit scenario, aangezien de callback-functie ervoor zorgt.
Employee.findOne({
workEmail: employeeEmail,
},(err,data)=>console.log("data",data);