Ik zou zeggen dat je meerdere indexen kunt invoegen in de eigenschap indexen (maar ik heb geen tijd gehad om het te testen):
indexes={
@ORM\Index(name="index_name", columns={"database_column1","database_column2"}),
@ORM\Index(name="index_name2", columns={"database_column1"}),
@ORM\Index(name="index_name3", columns={"database_column2"})
}
Ik hoop dat dit je helpt