Ervan uitgaande dat er geen problemen met CSV-citaten zijn:
$newStr = str_replace( ',', '<br>', $string );
BEWERKEN:
Nadat ik je terugdraaiing heb gezien, zie ik dat je de , . eigenlijk wilt vervangen met een newline teken zoals \r , \n of \r\n :
$newStr = str_replace( ',', "\n", $string );