Ik heb net een antwoord gekregen van het team van Fixie:
Toen ik vroeg naar de mogelijkheid om SOCKS voor dit geval te gebruiken, antwoordden ze:
Dus blijkbaar is er in mijn geval geen manier om een verbinding met MongoDB Atlas-cluster tot stand te brengen met behulp van mangoest via de proxy-oplossing die wordt aangeboden door Fixie (Heroku-add-on).